1.斑马鱼目标基因的基本分析：通过对斑马鱼整体或切片的原位杂交、免疫组化，可对该目标基因的在不同时相的表达组织特异性进行基本分析；

2.斑马鱼目标基因的过表达和分析：显微注射体外合成的目标基因野生型或突变型mRNA是高效分析目标基因功能的重要手段；

3.斑马鱼目标基因表达的抑制和分析：设计、合成、注射目标基因特异的吗啡啉修饰寡聚核苷酸可高效分析目标基因的功能；

4.利用斑马鱼系统可对小分子化合物、药物的生理活性、药理或毒理进行快速分析

5.斑马鱼行为分析是分析评估神经精神系统功能的有力工具，可研究基因等内源因素、或药物等环境因素对神经精神系统的影响和作用。