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     SSRSimple Sequence Repeats),又叫微卫星DNA(Microsatellite DNA)。重复单元很短,只有1-6 bp;重复数可变,总长度为几十个bp,分布于整个基因组的不同位置上。微卫星DNA两端的序列一般是相对比较保守的单拷贝序列,据此可设计特异引物进行PCR扩增。根据串联重复数不同,便可以揭示微卫星DNA长度的多态性,具长度多态性的片段可用作分子标记。微卫星标记因具多态性丰富、重复性好、共显性等优点广泛应用于遗传图谱构建、种群遗传学、指纹分析、系统发育等研究领域。


    应用领域

     

    1、可进行未知基因组的物种进行SSR标记开发。

     

    2、文库筛选率高,可最高达70%;而传统方法筛选率在30%左右。

     

    3、数据产出量高,可得到几十万条包含SSR位点的序列。

     

    4、结合高通量测序技术及强大的生物信息分析技术,可对整个未知基因组进行搜寻,提高分子标记的开发力度。更容易发现新的SSR标记。

     

    5、更专业的SSR标记分析系统,个性化的数据分析。