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  • 服务简介:

    Affymetrix SNP芯片服务

    芯片推荐:1、Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0

    芯片介绍:Affymetrix Genome-Wide Human SNP 6.0芯片产品的涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物:包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化(CNV,Copy Number Variation)的探针:

    1)482,000个SNPs来自于前代产品500K和SNP5.0芯片;
    2)424,000个SNP包括了源来于国际HapMap计划中的标签SNPs,X,Y染色体和线粒体上更具代表性的SNPs,以及来自于重组热点区域和500K芯片设计完成后新加入dbSNP数据库的SNP;
    3)202,000个用于检测5,677个已知拷贝数变异区域的探针,这些区域来源于多伦多基因组变异体数据库。该数据库中的每个3,182个非重叠片断区域分别平均用61个探针来检测;
    4)744,000个探针平均分配到整个基因组上,用来发现未知的拷贝数变异区域。

     

    具体应用:除了SNP基因分型之外,还能进行CNV研究。从而能够进行Copy-neutral LOH/UPD检测,亲子鉴定,纯合性分析、血缘关系鉴定。


    芯片推荐:2、Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array

    芯片介绍:这款芯片与Human SNP 6.0 芯片类似,既包含SNP探针,也包含CNV探针。一共涵盖623,124个SNP位点和916,269个CNV探针。


    芯片推荐:3、Affymetrix GeneChip Rice 44K SNP Genotyping Array

    芯片介绍:芯片覆盖indica, aus, tropical japonica, temperate japonica, and group V (“aromatic”)多个水稻亚种的44,1000个SNP。
    芯片特点:
    1.全基因组覆盖:每10kb至少包括1个SNP,每个SNP设计12个探针技术重复相关系数R2 > 99%。
    2.简便的样本:叶组织或抽提的DNA便可快速灵活的对遗传种质进行鉴定和分类。
    3.从实验样本DNA到数据快速转换。


    其它物种商品化SNP芯片包括:牛(bovine和buffalo),鸡,水稻,生菜,胡椒,拟南芥,狗和小鼠。
    如有其它物种定制需求,可电话咨询。