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微生物群落多样性与代谢组联合数据分析

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  • 所在地
    上海市嘉定区
检测能力
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服务周期
  • 1 天
  • 服务周期以订单生效且样品收到后第2个工作日起算
报告类型
  • 普通报告
  • 认可报告
报告形式
  • 电子版
  • 纸质版
报告语言
  • 中文版
报告资质
  • CNAS
  • CMA
上海凌恩生物科技有限公司
  • 服务简介

    分析内容:

    1.OTU聚类与物种注释:数据统计、OTU聚类、分类学分析

    2.alpha多样性:稀释曲线、shannon曲线、多样性指数、rank abundance(样本≥2)、specaccum物种累积曲线(样本≥5)、多样性指数箱式图(分组≥2,每组样本≥5

    3.物种组成分析:venn图(花瓣图)(样本≥2)、组分图(样本≥2)、core microbiome分析(样本≥2)、heatmap图(样本≥2)、megan物种组成树、优势物种组分图、聚类树与组分图结合分析(样本≥2)、krona多级物种组成图graphlan物种组成树

    4.比较分析(beta多样性):组间距离分析(分组≥2,每组样本≥3CA(样本≥3)、PCA(样本≥3)、PCOA(样本≥3)、3D-PCOA(样本≥3)、多样本相似度聚类树(样本≥3)、Nmds(样本≥3)、unifrac系统进化树、anosim(分组≥2,每组样本≥3)、adonis分组≥2,每组样本≥3

    5.差异分析:anova方差分析(分组≥2,每组样本≥3)、wilcoxon秩和检验分析(分组=2,每组样本≥3)、kruskal wallis检验分析(分组≥2,每组样本≥3)、metagenomeSeq分析(分组=2,每组样本≥3)、lefse分析(6≥分组≥2,每组样本≥3)、STAMP差异分析(分组≥2,每组样本≥3)关键物种差异比较柱状图(分组=2,每组样本≥3)

    6.相关性分析RDA/CCA分析(样本≥环境因子≥3)、相关性热图(样本≥5)、相关性网络图(样本≥5)、network组成分析、mantel test分析(样本≥3)、partial mantel test分析(样本≥3)、procrustes分析分组≥,每组样本≥3

    7.功能预测picrust kegg功能预测(16s数据)picrust cog功能预测(16s数据)、tax4fun kegg功能预测(16s或者18s数据)、功能分布图、功能比较分析(样本≥3)、差异功能分析(分组=2,每组样本≥3)、物种/功能/理化因子结合分析样本≥3

  • m***j
  • 食品营养成分检测[蛋白质检测套餐]
  • 2018-07-12
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